Die Hauptaufgabe des Generalsekretariats der Gesundheits-, Sozial- und Integrationsdirektion ist die Beratung und Unterstützung des Gesundheits-, Sozial- und Integrationsdirektors bei der Führung der Direktion und bei der Vorbereitung von Entscheiden im Bereich Gesundheit und Soziales. Das Generalsekretariat stellt als Stabsstelle und Koordinationsdrehscheibe die Aufgabenerfüllung gegen innen und aussen sicher.