Das Kantonsapothekeramt ist zuständig für die Überwachung der Sicherheit und Qualität bei der Herstellung, Distribution, Abgabe und klinischen Prüfung von Heilmitteln, soweit dies in kantonaler Zuständigkeit liegt.

Nebst hoheitlichen Aufgaben gibt das Kantonsapothekeramt im Bereich Heilmittel generell Auskunft bei Fragen von Fachpersonen, Behörden und der Öffentlichkeit zu Heilmitteln.